MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_5p

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018884	CT	3	6	34	39	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018884	AGT	2	6	63	68	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018884	ATT	2	6	210	215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403588
4	NC_018884	TTG	2	6	239	244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403588
5	NC_018884	CAA	2	6	248	253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403588
6	NC_018884	A	6	6	252	257	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
7	NC_018884	TGT	2	6	325	330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403588
8	NC_018884	GTA	2	6	344	349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403588
9	NC_018884	CATT	2	8	371	378	25 %	50 %	0 %	25 %	514403588
10	NC_018884	AGA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
11	NC_018884	CAAA	2	8	442	449	75 %	0 %	0 %	25 %	514403588
12	NC_018884	AGA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
13	NC_018884	A	6	6	644	649	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
14	NC_018884	TAGAAG	2	12	687	698	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514403588
15	NC_018884	AGT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403588
16	NC_018884	ACA	2	6	763	768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403588
17	NC_018884	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
18	NC_018884	CAA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403588
19	NC_018884	A	7	7	839	845	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
20	NC_018884	AAAAG	2	10	847	856	80 %	0 %	20 %	0 %	514403588
21	NC_018884	GAA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
22	NC_018884	AAC	2	6	943	948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403588
23	NC_018884	GAA	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
24	NC_018884	GA	3	6	1018	1023	50 %	0 %	50 %	0 %	514403588
25	NC_018884	A	6	6	1058	1063	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
26	NC_018884	AGA	2	6	1080	1085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
27	NC_018884	ATA	2	6	1122	1127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403588
28	NC_018884	AGA	2	6	1135	1140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
29	NC_018884	AAT	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403588
30	NC_018884	AGA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
31	NC_018884	TAAA	2	8	1206	1213	75 %	25 %	0 %	0 %	514403588
32	NC_018884	A	6	6	1295	1300	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
33	NC_018884	TTA	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403588
34	NC_018884	AAG	2	6	1402	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
35	NC_018884	ATT	2	6	1461	1466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018884	ACTA	2	8	1471	1478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018884	TG	3	6	1515	1520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018884	T	6	6	1533	1538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018884	A	6	6	1624	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018884	T	7	7	1654	1660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018884	AT	3	6	1678	1683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018884	TA	3	6	1708	1713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018884	TAA	2	6	1728	1733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018884	TGT	2	6	1763	1768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018884	TAAT	2	8	1808	1815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018884	TAA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018884	TGT	2	6	1893	1898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018884	T	7	7	1929	1935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018884	TGT	2	6	1953	1958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018884	AAT	2	6	2034	2039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018884	AAAG	2	8	2088	2095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018884	GAT	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018884	ATC	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018884	A	6	6	2210	2215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018884	A	7	7	2324	2330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018884	T	7	7	2388	2394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018884	ATGA	2	8	2404	2411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018884	ACA	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018884	A	7	7	2472	2478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018884	T	7	7	2530	2536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018884	AATT	2	8	2547	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018884	AATT	2	8	2571	2578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018884	ATA	2	6	2590	2595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018884	GAG	2	6	2637	2642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018884	AAAAG	2	10	2714	2723	80 %	0 %	20 %	0 %	514403589
66	NC_018884	AAG	3	9	2752	2760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403589
67	NC_018884	AAAGT	2	10	2841	2850	60 %	20 %	20 %	0 %	514403589
68	NC_018884	T	6	6	2898	2903	0 %	100 %	0 %	0 %	514403589
69	NC_018884	GAA	2	6	2910	2915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403589
70	NC_018884	ATTGT	2	10	2962	2971	20 %	60 %	20 %	0 %	514403589
71	NC_018884	ATTC	2	8	2979	2986	25 %	50 %	0 %	25 %	514403589
72	NC_018884	ATT	2	6	3143	3148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403589
73	NC_018884	ATT	2	6	3162	3167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403589
74	NC_018884	AAC	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403589
75	NC_018884	TTTA	2	8	3209	3216	25 %	75 %	0 %	0 %	514403589
76	NC_018884	A	6	6	3237	3242	100 %	0 %	0 %	0 %	514403589
77	NC_018884	T	6	6	3256	3261	0 %	100 %	0 %	0 %	514403589
78	NC_018884	T	7	7	3270	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018884	ATA	2	6	3353	3358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018884	TAG	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018884	ACTCTC	2	12	3388	3399	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018884	TA	3	6	3400	3405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018884	T	6	6	3500	3505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018884	TTC	2	6	3599	3604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018884	ATT	2	6	3706	3711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018884	TAA	2	6	3716	3721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018884	T	6	6	3733	3738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018884	TTTGAA	2	12	3756	3767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018884	ATA	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018884	ATT	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018884	A	6	6	3830	3835	100 %	0 %	0 %	0 %	514403590
92	NC_018884	TTA	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403590
93	NC_018884	TATTT	2	10	3856	3865	20 %	80 %	0 %	0 %	514403590
94	NC_018884	T	6	6	3863	3868	0 %	100 %	0 %	0 %	514403590
95	NC_018884	TGC	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514403590
96	NC_018884	ATT	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403590
97	NC_018884	AAG	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403590
98	NC_018884	AATG	2	8	3980	3987	50 %	25 %	25 %	0 %	514403590
99	NC_018884	AGA	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403590
100	NC_018884	TA	3	6	4018	4023	50 %	50 %	0 %	0 %	514403590
101	NC_018884	AATG	2	8	4070	4077	50 %	25 %	25 %	0 %	514403590
102	NC_018884	AAT	2	6	4088	4093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403590
103	NC_018884	TGA	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403590
104	NC_018884	AT	3	6	4182	4187	50 %	50 %	0 %	0 %	514403590
105	NC_018884	CAG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514403590
106	NC_018884	TAG	2	6	4218	4223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403590
107	NC_018884	CAA	2	6	4289	4294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403590
108	NC_018884	ACT	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403590
109	NC_018884	TTTA	2	8	4443	4450	25 %	75 %	0 %	0 %	514403590
110	NC_018884	A	7	7	4479	4485	100 %	0 %	0 %	0 %	514403590
111	NC_018884	TGGTTC	2	12	4528	4539	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	514403590
112	NC_018884	TAA	2	6	4637	4642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403590
113	NC_018884	AGG	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018884	A	10	10	4666	4675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018884	TAA	2	6	4681	4686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403591
116	NC_018884	GTTTT	2	10	4723	4732	0 %	80 %	20 %	0 %	514403591
117	NC_018884	A	6	6	4752	4757	100 %	0 %	0 %	0 %	514403591
118	NC_018884	TA	4	8	4760	4767	50 %	50 %	0 %	0 %	514403591
119	NC_018884	AT	3	6	4808	4813	50 %	50 %	0 %	0 %	514403591
120	NC_018884	TAT	2	6	4887	4892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403591
121	NC_018884	A	6	6	4911	4916	100 %	0 %	0 %	0 %	514403591
122	NC_018884	A	7	7	4959	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	514403591
123	NC_018884	A	6	6	5001	5006	100 %	0 %	0 %	0 %	514403591
124	NC_018884	AAT	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403591
125	NC_018884	A	6	6	5041	5046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018884	T	6	6	5115	5120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018884	AATT	2	8	5121	5128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018884	AATG	2	8	5156	5163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018884	GAA	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.